有了官军的身份，郑芝龙变成了货真价实的“官匪一家”。

在陆地上收税，郑芝龙是福建的土皇帝。在大海里继续扩展自己的海盗事业，郑芝龙的势力一直发展到九州岛、长崎、千叶岛。

南明弘光皇帝朱由崧登基以后，册封郑芝龙为南安伯，福建总镇，负责福建全省的抗清军务。

没想到眨眼之间风云突变，弘光帝朱由崧被满清鞑子俘虏。

南阳王朱聿键突然来到福建，郑芝龙闻讯欣喜若狂：“什么乱七八糟的大明、大清，说到底都一个球样，不就是换个主子的事情吗？现在朱聿键跑到老子的地盘上，真是天助我也！曹操能够挟天子以令诸侯，老子为什么不可以？”

要想挟天子以令诸侯，首先就要弄出一个天子。

弘光元年闰六月丁未，郑芝龙、郑鸿逵俩兄弟在福州拥立朱聿键于福州称帝，宣布从七月初一起改弘光年号为隆武元年。改福建布政司称福京，改福州行在为天兴府，改布政司为行殿，建行在太庙、社稷及唐国宗庙。

朱聿键知道自己身上没有半文钱，手下没有一个兵。现在赶鸭子上架当了皇帝，自然就要大封功臣，但愿通过封官许愿能够建立自己的班底。

大功臣自然就是福建郑家。

于是朱聿键大笔一挥，晋升郑芝龙为平虏侯、郑鸿逵为定虏侯，封郑芝豹为澄济伯、郑彩为永胜伯。其中，郑芝龙负责南明所有军事事务。

福建郑家一门两侯两伯，而且名誉上掌握着隆武朝廷所有兵马的指挥大权。郑家一时间权顷朝野，郑芝龙的政治生涯达到顶峰。

虽然朱聿键想打回自己的老家北京，但是郑家都是海盗头子，目的是为了让自己能够名正言顺做生意，怎么可能让自己的海盗兄弟们北伐？

与此同时，在绍兴还有鲁王朱以海建立的小朝廷，对外自称“监国”，根本不承认福建朱聿键的隆武朝廷。

家破人亡，山河倾颓之际，造反起家的朱棣后人们继承了造反因子。他们根本没有想过团结起来驱逐鞑虏，而是抓住机会扩张自己的实力，希望自己能够一步登天。

隆武皇帝朱聿键登基以后，也希望有所作为，成为一代“中兴之主”。他提出“消除党争，用舍公明”的主张，规定“小贪必杖，大贪必杀”。

与此同时，还派遣兵科给事中刘中藻为使者前往绍兴向鲁王朱以海颁诏，宣布两家无分彼此，鲁监国委任的朝臣可以到隆武朝廷中担任同等官职。