即使录取时的优秀学生，即所谓“正课生”，如果旷课，平时考试成绩不能保持在前列，也有可能被降为“附课生”。

清代均州南阳书院规定，以缺考的次数和考试的等级来确定升降，内课生如有一次不应课者，停止发放一月膏火钱；两次不应课者，降作附课。

正课一连三次不考，超特等者降作附课以内，附课连考三次超等者，可以升补为正课。降级的同时，其膏火钱也会降低标准发放，甚至不发。

如刚来书院听来的考试制度，奖励很丰厚，作弊惩戒的严苛程度不可小觑。

书院考试纪律很严格，试卷凭“浮票”领取，并设编号。学生考试时出现作弊、抄袭等不诚信行为，都会受到惩罚。

抄写雷同及不在院作文，并次日交卷者不列榜，初次不列榜，罚停膏?半月；再次不列榜，降作附课，冒名顶替者逐出住院。

书院“德育”先于“智育”。

书院还有讲会，自由探讨，各抒己见，不同学派能在此进行辩论。

讲会分为月会和大会两种，月会每月初八、二十三举行、大会是每年九月十五日，巳时开讲，申时散会。无论月会还是大会都是举办三天。

日常教学中，山长授课一般放在每月的一、三、六、八日。书院一般每月有三次课试，从出题到评阅，均由山长负责。

讲会的开讲仪式非常隆重。

开讲前由山长、副讲亲自带领全体学生到大成殿向先师神位四拜，然后到讲堂，由引赞喊“登讲席”，山长、副讲登上讲席后，引赞喊“三肃揖”。